市场上常见流式数据分析软件和FlowJo之比较

Why FlowJo?

很多人有这个问题,仪器本身就带有软 件,我为什么还需要第三方软件?
为了让大家了解不同软件之间的区别和功能, 下面将市场上常见的几款机器自身携带的软件 和FlowJo做一个系统的比较。

1.操作灵活性
FlowJo 可以在几乎所有的电脑操作系统上 使用, 你的电脑可以是PC的各种Windows系统 (WinXP, Win 7, Vista), 也可以是苹果 Macintosh系统,甚至FlowJo也可以在Unix系 统上操作。
相 对于市场上其它的软件来说,像Becton Dickinson的CellQuest,只能在苹果机上使用, 限制了大部分的PC用户。而另外一款机器自 带的FACSDiva软件,则只能在其特定配置的 机器电脑上使用。FlowJo软件则可以安装到用 户自己的电脑上使用。只要电脑最低配置有 512MB内存,10G的空余磁盘空间就可以运 行。使用FlowJo的用户可以将数据从流式仪上 复制到自己的电脑上,从流式实验室繁杂的环 境脱离出来,在用户喜欢的工作环境中,边喝 咖啡或茶,边分析数据,而不必拘泥于对食物 和衣着有严格限制的实验空间。原来枯燥的实 验数据分析可以这样的简单轻松!

2.语言环境
FlowJo中文版,可以让广大的流式用户, 在自己熟悉的母语环境中分析数据。你不必去 猜测那些深奥难懂的英文术语,也不必犹豫猜 测某个英文窗口是什么意思。你可以很轻松的 将FlowJo的操作环境从英文更改为中文,而不必重新安装软件。FlowJo是目前市场上唯一一 款中文操作环境的流式分析软件。
FlowJo提供中文的操作手册,中文视频教 程和中文的技术支持服务。减少了很多语言的 障碍,尤其是对于英语不是他们的第二语言的 用户来说。

3.功能优势之-简单易学
很 多流式用户希望可以很快的得到分析结 果,而不是花很多时间在学习一项新的工具 上。那FlowJo恰恰是满足了这个需求。不管你 有没有接触过流式及流式方面的基础知识,不 管你的背景,年龄,打开FlowJo之后,保证你 10分钟就可以上手,对你的实验数据进行分析 设门及数据导出!即使是80岁的老奶奶我们都 有信心其可以学会及掌握FlowJo!
FlowJo其独特的 流程和设计,让数 据分析像呼吸吃饭 一样的自然和简 单。这是其它软件 所不能企及的。

4.功能优势之-多种特殊分析模型
FlowJo 除了常用的流式免疫表型之类的 分析功能之外,还附带多种特殊分析模型, 如细胞周期分析,动力学分析(钙离子流量)及 增殖模型。这些都是软件自带功能并不需额 外购买。仪器自带的软件都不具备这些功 能。

5.功能优势之-采集后荧光补偿
FlowJo 可以做数据的采集后荧光补偿。 BD公司的CellQuest,不具备这个功能。所谓 采集后补偿及在采集了实验数据和单染样品 之后,再在软件里进行荧光的补偿调节。很 多人倾向于在数据采集的时候进行荧光补 偿,并错误的认为那才是最正确的补偿方 式,其实这是一种非常错误的认识。在模拟 信号的机器上的荧光补偿很多时候是目测为 准,及大家都尊从的”横平竖直“的标准。目测 调整荧光条件可能会导致巨大的误差而不自 知。正确的方法是用方程式去计算阳性和阴 性细胞群的荧光强度中位数值(MFI, median fluorescence intensity),从而得到最佳的补 偿条件。Diva软件提供软件的自动计算功 能,但是却不能轻松的进行补偿后的调整。 FlowJo同时具备自动计算和补偿后的再调 节。是FlowJo里,你也可以再次的对你的补 偿条件进行微调,再也不用因为补偿出错而 懊恼了。

6.功能优势之-贴心功能设计
✦FlowJo里你可以自定义门的名称,如命 名门为”淋巴门”, “FoxP3阳性门” 或者英文 的”lymphocytes”, “FoxP3+cells”等等。各个 门不再是干巴巴的代号,而是有血有肉的精 确命名的细胞群。
✦图片的叠加,FlowJo图片叠加功能非常 好用,只需将2个图片拖在一起即可。而其它 的软件则可能需要很复杂的步骤才可以办到 或者是根本没有这个功能。叠加的图片还可 以制作成立体的三维图。
✦ 直接将数据导出到Excel文件!FlowJo可 以很轻松的将数据导出到Excel文件,省去了 很多抄写的麻烦。在很多老式的流式仪上, 如果你想要将数据结果导出来的话,只能打 印最终的分析文稿,或者手动抄写下来。欢迎你步入21世纪!FlowJo可以一步式操作, 直接将所有的样品数据导出为Excel文件。
✦3D 视图
✦动画数据导出。你可以将图片数据以动 画的形式导出为一个动态电影。

7.功能优势之-强大的分析功能设计
你知道什么是数据联接吗(Concatenate)? 顾名思义,就是将2个或者2个以上的FCS数 据,整合为一个FCS数据。这个数据联接功 能在以下情况下,可以帮你解决燃眉之急或 者将你的数据分析提高到一个新的档次
✦同一管样品,不小心分2次采集,生成了 2个FCS数据。如果你要分析的是表达量很低 的细胞群,单个FCS数据细胞总数不够的情 况下,你可以利用数据联接的功能将之合并 为一个数据。
✦ 在抗体滴定实验,或者是样品不同时间 点的药物处理及其它涉及到实验中样品只有 一个处理条件有变,其余参数均不变的情况 下,可以将不同的数据联接为一个,并将所 有数据点图呈现在一个图像窗口里,从而观 察随着条件的变化,细胞抗体表达的渐变过 程。你知道什么是校准,衍生参数轴,和细胞 群比较功能吗? 也许你从来没有听说过这些 功能,不过没有关系,如果想要了解更多详 细内容的话,可以参阅我们的网站,你也可 以下载FlowJo软件,开始30天的免费试用来 亲手体会FlowJo的强大!你也可以拨打我们 的热线电话400-680-5527,或者email: contact@flowjochina.com 获取免费的使用说 明和学习DVD。
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附件1. FlowJo与其它软件的功能比较表格

附件2. FlowJo被各大学术杂志引用数据

FlowJo 是被使用最广泛的流式数据分析软件,各大高影响力因子期刊发表的流式图表绝大部分 是用FlowJo分析的。如Nature Immunology收录的10篇文章里,有7.8篇文章用FlowJo做数据分 析。剩余的2.2篇是机器自带软件分析的。